Власти Парижа объявили о планах открыть три плавательных места на реке Сена для общественности к июню следующего года. Однако существовало риски, что река не будет достаточно чистой в день триатлонной гонки, особенно учитывая ее изменчивое качество от дня к дню. Дожди часто вызывали переполнение канализационных систем в реке, что приводило к значительному увеличению концентрации бактерий, вызывающих инфекции. Сет Райдер, один из 55 участников мужской гонки, принял нестандартные меры для подготовки к возможному воздействию бактерий. В интервью в прошлую субботу он сказал: "Мы знаем, что будет некое воздействие бактерий, поэтому я просто пытаюсь подвергнуть себя небольшому количеству бактерий в повседневной жизни. Маленькие вещи в течение дня, такие как мытье рук после похода в туалет и вещи в этом роде". После прыжка в реку Сену спортсмены готовы к соревнованиям по велоспорту и бегу перед возвращением на стартовую точку. Международный союз триатлонистов заявил, что мужские гонки на Олимпийских играх в Париже не состоятся во вторник из-за повышенного уровня загрязненности в реке Сене, что ставит под угрозу организаторов и оставляет спортсменов перед новой неопределенностью. Гонка была перенесена на среду, начнется в 10:45 утра (08:45 по Гринвичу), сразу после гонки женщин, запланированной на весь утро. Организаторы уверены, что качество воды улучшится вовремя для гонки после сильных дождей, выпавших в прошлую пятницу и субботу, что привело к загрязнению реки. Они сообщили рано утром во вторник: "Несмотря на улучшение качества воды за последние часы, показатели уровня загрязненности в некоторых точках маршрута плавания все еще выше допустимого предела". Если уровень бактерий останется чрезмерно высоким к утру следующего дня, то мужские и женские гонки могут быть отложены до следующей пятницы, запланированной на такие случаи. Если качество воды не улучшится достаточно к пятнице, спортсмены будут вынуждены соревноваться в дуатлоне вместо плавания. Приблизительно 50 человек собирались на солнечном мосту Инвалидов к семи утра для наблюдения за гонкой, но им пришлось узнать, что она отложена. Власти Парижа вложили огромные суммы для того чтобы сделать Сену пригодной для плавания, как ключевое наследие игр, потратив 1.4 миллиарда евро (1.51 миллиарда долларов) на инфраструктуру канализации для его удержания и ограничения сброса в речной поток. Ранее в этом месяце мэр Парижа Анн Идальго сама поплыла в реке в попытке убедить сомневающихся.
